Факультет биологии является одним из старейших в РГПУ им. А. И. Герцена. Как самостоятельное структурное подразделение факультет биологии (до 1994 г. — факультет естествознания) организован в 1920 г.
Среди его основателей выдающиеся учёные нашей страны, такие как академик В.Л. Комаров, впоследствии президент АН СССР; академики: А.Н. Максимов, К.М. Быков, Ф.Д. Сказкин; члены-корреспонденты: В.А. Догель, Ю.И. Полянский, Н.М. Верзилин; заслуженный деятель науки — К.М. Суханова; профессора: С.В. Герд, Ф.Е. Тур, Б.Е. Райков, П.И. Боровицкий, С.И. Гальперин, Н.А. Рыков, Л.В. Латманизова, В.В. Аникиев и ряд других ученых.
За каждым из них стоит крупное направление научных и методических исследований, монографии, учебники и учебные пособия. Их имена хорошо известны многим поколениям учителей-биологов.
В настоящее время факультет сохраняет лучшие учебные, научные и методические традиции и развивает новые направления подготовки.
Факультет активно развивает магистратуру, реализуя три программы магистратуры:
18 апреля 2023 года на факультете биологии состоялся «День открытых дверей». Прошло это важное для факультета биологии мероприятие под девизом: «Поступай правильно: выбирай факультет биологии Герценовского университета!». С приветственным словом перед собравшимися выступил декан факультета биологии Александр Николаевич Стрельцов, который рассказал о том, какие условия создаются на факультете и в Университете для того, чтобы обеспечить успешное обучение по образовательным программам факультета. Ответственный секретарь приемной комиссии факультета биологии Анастасия Леонидовна Левченко провела виртуальную экскурсию по факультету биологии и сообщила о правилах приема в Университет и на факультет биологии в 2023 году. С большим интересом гости факультета слушали выступление обучающихся факультета биологии: Н. Дубровина, Е. Мосиной. Собравшиеся живо интересовались тем, как организован учебный и воспитательный процесс на факультете.