Факультет биологии является одним из старейших в РГПУ им. А. И. Герцена. Как самостоятельное структурное подразделение факультет биологии (до 1994 г. — факультет естествознания) организован в 1920 г.
Среди его основателей выдающиеся учёные нашей страны, такие как академик В.Л. Комаров, впоследствии президент АН СССР; академики: А.Н. Максимов, К.М. Быков, Ф.Д. Сказкин; члены-корреспонденты: В.А. Догель, Ю.И. Полянский, Н.М. Верзилин; заслуженный деятель науки — К.М. Суханова; профессора: С.В. Герд, Ф.Е. Тур, Б.Е. Райков, П.И. Боровицкий, С.И. Гальперин, Н.А. Рыков, Л.В. Латманизова, В.В. Аникиев и ряд других ученых.
За каждым из них стоит крупное направление научных и методических исследований, монографии, учебники и учебные пособия. Их имена хорошо известны многим поколениям учителей-биологов.
В настоящее время факультет сохраняет лучшие учебные, научные и методические традиции и развивает новые направления подготовки.
Факультет активно развивает магистратуру, реализуя три программы магистратуры:
4 апреля 2023 года на кафедре методики обучения биологии и экологии прошли Герценовские чтения, посвящённые 120-летию со дня рождения учёного-методиста Николая Михайловича Верзилина на тему «Наследие Н.М. Верзилина и отражение его идей в современном биологическом и экологическом образовании».
Участие в конференции приняли более 90 человек из различных регионов нашей страны: Санкт-Петербурга, Москвы, Вологодской области, Самарской области, Свердловской области, Республики Северной Осетии – Алании.
С приветственным словом к участникам конференции обратились заведующая кафедрой методики обучения биологии и экологии, доктор педагогических наук, профессор Наталья Дмитриевна Андреева и доктор педагогических наук, профессор, член президиума и академик-секретарь отделения биологии и географии Международной академии наук педагогического образования Владимир Васильевич Пасечник. В рамках конференции работа была посвящена следующим тематическим направлениям:
Н.М. Верзилин – учёный, методист, детский писатель.
Проблемы методики обучения биологии в современной школе.
Подготовка студентов к профессиональной деятельности в области биологического и экологического образования в условиях современных вызовов.
Отражение проблем биологического и экологического образования в общеобразовательной школе в исследованиях студентов и аспирантов.