Предыстория возникновения Института востоковедения РГПУ им. А. И. Герцена связана с созданием кафедры восточных языков в этом вузе. Стремление обучать студентов восточным языкам стало закономерным следствием стремительного развития Китая, Индии, Японии, двух корейских государств, а также Вьетнама на рубеже XX-XXI веков.
Кафедра восточных языков была создана в 2002 году (приказ №) на базе Лингвистического центра, директором которого была доктор пед. наук, проф. Н. В. Баграмова.
Возглавил кафедру восточных языков к.ф.наук, доцент В. М. Зелко, китаист по базовому образованию, владеющий однако и арабским языком. Он обеспечил реализацию программ по четырем восточным языкам: арабскому, китайскому, корейскому и японскому. Преподавание велось в группах факультета иностранных языков, Института Народов Севера и всех неязыковых факультетов университета (где любой студент по желанию мог выбрать вместо английского языка один из вышеперечисленных восточных языков и продолжить знакомство со страной в ходе стажировки в рамках бесплатного студенческого обмена). Всего в течение года кафедра осуществляла подготовку до 120 студентов. При этом восточные языки были достаточно востребованными и на вечерних курсах. Однако на тот момент китайский, корейский и японский языки изучались как вторые иностранные при первом английском на факультете иностранных языков и при первом родном, как правило, долганском, в Институте Народов Севера. Особенность организации обучения восточному языку как второму иностранному заключалась в том, что ему начинали обучать со второго курса, следовательно, обучение длилось у специалистов в течение четырех лет, а у бакалавров — трех.
Первым выпуском стали студенты со вторым японским языком, обучение которых началось еще до формального создания кафедры в 1995 году.
Вторым выпуском стали студенты, изучавшие китайский язык как второй иностранный, а последним начал изучаться корейский язык (в 2005 году).
Уровень подготовки выпускников позволял им устраиваться работать на совместные предприятия или продолжать свое обучение в стране изучаемого языка. В связи с этим, стало понятно, что требуется дальнейшее совершенствование процесса обучения восточным языкам в РГПУ им. А. И. Герцена. Первоочередной задачей стала разработка собственных учебных изданий, учитывающих удаленность петербургских студентов от изучаемых стран.
С ноября 2012 года исполняющей обязанности заведующего кафедрой восточных языков стала к. пед. наук, доцент Л. А. Воронина, которая в апреле 2013 года была избрана на должность заведующего кафедрой восточных языков. Кафедрой был взят курс на разработку учебного плана по направлению «Лингвистика» (профиль «Теория и методика обучения языкам и культурам»). Первым был подготовлен пакет документов для открытия набора в группы с основным китайским языком как самым востребованным.
Восточные языки как основные (или первые иностранные) начали преподаваться только с 01.09.2014 г., когда кафедрой был осуществлен первый за ее историю набор в две группы с первым китайским языком как иностранным. С 01.09.2016 г. была открыта группа с основным корейским языком, а с 01.09.2017 г. — с основным японским.
После общеуниверситетской реорганизации по обучению иностранным языкам в 2015 году (2014-2015 уч.год) кафедра восточных языков полным составом стала структурным подразделением института иностранных языков (ИИЯ) РГПУ им. А. И. Герцена (директор д.ф.наук, проф. Т.И. Воронцова).
В 2018 году на заседании Ученого совета РГПУ им. А. И. Герцена от 28.09. 2018 было принято решение о создании Института востоковедения, и с 1 октября 2018 года приказом № 0101-202/01 он был образован. Возглавил Институт востоковедения д. филос. н., к.и.н., проф. А.Л.Вассоевич. В настоящее время в состав Института востоковедения входят три кафедры: Кафедра китайской филологии (заведующая кафедрой к.п.н. Т.В.Якунина); кафедра восточных языков и лингводидактики (заведующая кафедрой доцент А.Ден); кафедра языков и культур исламского мира (заведующий к.ф.н. доцент В.Н.Блондин).
С 2019 года вновь открылось и возобновило свою работу арабское отделение. Разработаны магистерские программы по китайскому, корейскому и японскому языкам. Планируется открытие кафедры древневосточных языков и создание магистерской программы «Религии Древнего Востока» совместно с факультетом истории и социальных наук. Намечены пути сотрудничества с рядом зарубежных вузов, в том числе с Европейским гуманитарным университетом в Вильнюсе и Новым Болгарским университетом в Софии.