В Российском государственном педагогическом университете им. А. И. Герцена давно сложилась и полноценно функционирует система подготовки и аттестации научных и научно-педагогических кадров. На протяжении многих лет в аспирантуре и докторантуре университета проходят подготовку с защитой диссертаций специалисты со всей территории Российской Федерации, бывшего Советского Союза, а также граждане иностранных государств. 

В настоящее время в РГПУ им. А. И. Герцена реализуется подготовка аспирантов по 65 научным специальностям. На базе университета функционирует 24 совета по защите диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук, в которых проходят защиты по 44 научным специальностям. Такое количество советов и специальностей в первую очередь обусловлено тем, что подготовку в вузе проходят специалисты практически по всем отраслям науки и логическим завершением подготовки в аспирантуре и докторантуре является защита диссертации в том совете, специалисты которого участвовали в подготовке и профессиональном росте соискателя.

Другим важным фактором является наличие в вузе научных школ, готовящих научные и научно-педагогические кадры высшей квалификации по различным отраслям науки. Необходимо отметить, что большинство научных и научно-педагогических кадров, которые проходят подготовку в университете, являются представителями различных регионов страны.

По причине отсутствия своих региональных диссертационных советов все подготовленные специалисты защищают диссертации в Герценовском университете. По той же причине большое число соискателей ученых степеней, прошедших подготовку в своих организациях, предпочитают защищаться в диссертационных советах РГПУ им. А. И. Герцена.

Общий контроль деятельности по подготовке диссертационных исследований, сопровождению докторантов, аспирантов и лиц, прикрепленных к Университету, а также контроль деятельности диссертационных советов осуществляет Управление подготовки и аттестации кадров высшей квалификации.